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La mayoría de enfermedades raras presentan una gran variabilidad de síntomas y heterogeneidad genética (muchos genes pueden estar implicados en una misma enfermedad). Por ello, el estudio de gran número de genes en un sólo análisis facilita la obtención de un diagnóstico, a la vez que reduce tiempo de espera al no requerir múltiples estudios secuenciales. Las técnicas de 'Secuenciación Masiva' o 'NGS' (Next Generation Sequencing) nos permite el estudio de multitud de genes (incluso de todo el genoma) a la vez, en un único ensayo. En el Laboratorio de Genética Molecular y Genómica disponemos de diversos paneles de NGS que incluyen un total 193 de genes, implicados en determinados síndromes genéticos, y un panel de genes asociados a cáncer hereditario. 

Próximamente, dispondremos del estudio del 'Exoma Clínico': el estudio de todas las regiones codificantes de genes conocidos asociados a enfermedades genéticas (alrededor de unos 5000 genes).

Una vez identificada la variante causal o posiblemente causal de la enfermedad, se puede realizar el estudio familiar: estudio de la presencia o ausencia de la mutación en los familiares con riesgo de ser portadores. Estos estudios se realizan mediante secuenciación Sanger dirigida, sin ser necesaria la utilización de métodos masivos de secuenciación.

En el Laboratorio de Genética Molecular también se lleva a cabo el análisis de pequeñas  duplicaciones (ganancias) o pequeñas deleciones (pérdidas) en regiones genómicas concretas, con una resolución a nivel de exón en los genes analizados, mediante técnicas de MLPA (Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification). También llevamos a cabo estudios de defectos de impronta (en el patrón de metilación) mediante una variante de esta técnica: el MS-MLPA (Methylation-Specific MLPA).

El incremento en el número de repeticiones de ciertas secuencias de trinucleótidos del ADN es la base molecular de ciertas enfermedades multisistémicas, especialmente neurológicas y neurodegenerativas. En el Laboratorio de Genética Molecular del CBGC realizamos ensayos moleculares para el estudio de algunas de estas enfermedades causadas por expansión de trinucleótidos.

Mediante la amplificación simultánea en un único tubo de distintas secuencias específicas, marcadas con distintos fluoróforos, es posible identificar la presencia de mutaciones que son más frecuentes en un determinado gen, como por ejemplo en el gen CFTR (implicado en el desarrollo de la fibrosis quística), en el que se pueden identificar mediante esta técnica las 50 mutaciones más recurrentes. 

Con esta técnica también es posible determinar semi-cuantitativamente la cantidad relativa de una secuencia respecto a las demás, por lo que se puede utilizar para realizar una valoración rápida de una posible aneuploidía (variación en el número de cromosomas). Esta es la técnica utilizada para el diagnóstico rápido de las aneuploidías más frecuentes en muestras prenatales y restos abortivos.